Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
时间:2024-10-03
肝(HCC)是最常见的原发性类型,随着死亡率的增加,已成为一个严重的全球健康问题【1】。尽管早期患者可以通过手术切除,但约有50%的患者最终需要全身治疗【2】。治疗取得了快速进展,其中阿替利珠单抗联合贝伐珠单抗已确立为晚期HCC的一线治疗方案。然而,总体反应率仍低于50%,这表明相当一部分晚期HCC患者无法从现有的治疗方法中受益,而缺乏对HCC肿瘤间和肿瘤内微环境异质性的充分认知可能是其中一个主要原因【3】。在过去的几年中,高通量技术极大地推动了我们对肿瘤微环境异质性的理解。尽管空间转录组学(ST)和scRNA-seq数据的综合分析有助于理解多样化细胞类型之间的空间关系,但由于ST方法分辨率低、缺乏蛋白质分布信息以及样本量有限,仍难以破译负责TIME重塑的直接细胞间相互作用以及跨肿瘤样本的空间特征。
2024年9月26日,王红阳/陈磊团队在Nature Cancer在线发表了题为Spatial Single-cell Protein Landscape reveals vimentin+ macrophages as immune suppressive in the microenvironment of hepatocellular carcinoma的研究论文,绘制了HCC单细胞空间蛋白图谱,充分解析了HCC肿瘤间空间异质性, 建立了预后相关的HCC空间分型(Spatial Pattern), 并整合多组学和体外实验揭示了Vimentin高表达的巨噬细胞与Treg细胞的空间互作促进HCC恶性进展。