人类肠道拥有多种多样的病毒,被认为在维持肠道内环境稳定中起着至关重要的作用。然而,肠粘膜病毒体异质性的大小,以及它如何不同地调节宿主炎症表型,如在克罗恩病(CD)中观察到的那些,仍然不清楚。
2026年2月9日,中山大学左涛团队在Cell Host & Microbe(IF=18.7)在线发表题为Gut DNA virome enterotype dictates inflammation heterogeneity through tuning the phage-bacteria-sphingosine-intestine axis in Crohn's disease的研究论文。
该研究发现了人体肠道病毒组存在两种噬菌体“肠型”,并揭示了噬菌体“肠型”对肠道噬菌体-细菌微生态的调控新机制,及其对克罗恩病炎症表现的影响,为个性化开发噬菌体疗法治疗克罗恩病提供了新的视角。
克罗恩病(CD)是炎症性肠病(IBD)的一种重要亚型,其发病机理与肠道微生物群的生态失调密切相关。患有CD的患者表现出严重程度不同的肠道炎症,而患有高度粘膜炎症的患者药物难治的风险增加,最终可能需要手术。CD患者炎症异质性的病因在很大程度上尚不清楚。
肠道细菌和宿主遗传素质的改变已被证明有助于CD的表型异质性,然而,可能驱动肠道细菌改变和随后宿主病理反应的上游因素仍然缺乏特征。
除了细菌微生物组(细菌组),人类肠道还包含大量噬菌体和真核病毒(统称为肠道病毒组),其数量比肠道细菌多1-10倍;其中,噬菌体占总肠道病毒体的95%以上,而真核病毒仅占一小部分。众所周知,肠道病毒体在个体间具有高度异质性,比肠道细菌体的异质性高得多。
人类肠道DNA病毒组的差异是否能形成类肠型变异,从而因果地引发CD肠道炎症的异质性,仍是一个引人入胜但尚未解答的问题。
机理模式图(图源自Cell Host & Microbe)
在这里,研究人员确定了人类的两种粘膜DNA病毒体肠型(E1和E2 ), E2受试者表现出更高的病毒体多样性和细微的噬菌体-细菌相关性。此外,E2肠型CD患者表现出比健康对照组更高的Wulfhauvirus丰度。E2病毒体在诱导小鼠肠道炎症中更具促炎性。
在机制上,新的富含E2-病毒体的噬菌体BTZT001P(属于Wulfhauvirus)溶原性感染多形拟杆菌,增加了鞘氨醇的产量。在下游,鞘氨醇抑制肠道中的共生细菌,导致肠道炎症恶化。该发现揭示了肠道病毒体的构型差异可能通过噬菌体-细菌-代谢物-肠道轴决定疾病的结果,突出了肠道噬菌体-细菌相互作用在健康中的重要性。
本研究由中山大学附属第六医院、澳大利亚莫纳什大学、新南威尔士大学、中国科学院深圳先进技术研究院、暨南大学生命科学与技术学院等单位合作完成。中山大学附属第六医院左涛研究员为本文的通讯作者,博士后温炜杰为第一作者。该工作得到了国家自然科学基金、广东省自然科学基金等项目的支持。
参考消息:https://www.cell.com/cell-host-microbe/fulltext/S1931-3128(26)00041-7