一类主要组织相容性复合体（MHC-I）分子在细胞表面呈现来源于细胞内抗原的肽，用于免疫监视。识别多肽-MHC-I（pMHCI）复合物特异性病变细胞的蛋白质可能具有相当大的治疗效用。特异性需要识别疾病相关肽内面向外的氨基酸残基，并避免与普遍表达的MHC广泛接触。

2025年7月24日，华盛顿大学David Baker（因在AI蛋白质领域的研究贡献获得2024诺贝尔化学奖）及刘炳旭共同通讯在Science在线发表题为Design of high-specificity binders for peptide–MHC-I complexes的研究论文，该研究使用RFdiffusion设计pMHCI结合蛋白，该蛋白与肽广泛接触，并从实验或预测的pMHCI结构开始鉴定了11个目标pMHCs的特异性结合物。

在结合到嵌合抗原受体后，设计了八个靶点，赋予肽特异性T细胞活化。总之，该研究的方法应该对蛋白质和基于细胞的pMHCI靶向具有广泛的实用性。

另外，2025年7月24日，丹麦技术大学Timothy P. Jenkins团队在Science在线发表题为De novo-designed pMHC binders facilitate T cell–mediated cytotoxicity toward cancer cells的研究论文，该研究提出了一个快速从头设计的迷你粘合剂（miBd）设计平台，利用最先进的生成模型来设计针对癌症相关肽结合的主要组织相容性复合体（pMHC） SLLMWITQC/HLA-A*02:01 （NY-ESO-1）的迷你粘合剂。

该研究鉴定了一种高亲和力的NY-ESO-1结合剂，并使用冷冻电镜确认了其结构，当将其结合到嵌合抗原受体中时，诱导NY-ESO-1+黑色素瘤细胞的杀伤。该研究进一步设计并验证了一种结构未知的新抗原pMHC复合物RVTDESILSY/HLA-A*01:01的结合物，证明了精准免疫治疗的潜力。

2025年7月24日，斯坦福大学K. Christopher Garcia团队在Science在线发表题为De novo design and structure of a peptide–centric TCR mimic binding module的研究论文，该研究设计了一个全新的α-螺旋TCR模拟物（TCRm），特异性针对人白细胞抗原(HLA) -A *02呈递的NY-ESO-1肽，具有高的靶向特异性和纳米摩尔亲和力（解离常数Kd = 9.5 nM）。

在2.05-Å分辨率下，TCRm-pMHC复合物的结构显示出一种刚性的TCR样对接模式，其不同寻常的程度集中在正面的NY-ESO-1侧链上，表明可能降低脱靶反应性。这些结果为用肽聚焦的α-螺旋TCR模拟物精确靶向肿瘤抗原提供了一条途径。