PARP1降解新突破:180055精准打击肿瘤细胞且无DNA捕获效应,开启癌症治疗新曙光
时间:2025-01-07
来源:100医药网 2025-01-07 14:51
本研究合成的PROTAC 180055可有效且选择性地降解PARP1、抑制其活性,无DNA捕获效应,在体内外对BRCA突变肿瘤细胞具杀伤性且对正常细胞影响小,是有前景的抗癌化合物。在癌症治疗的研究领域中,PARP1一直是备受瞩目的关键靶点。PARP1在DNA修复过程中扮演着极为重要的角色,它能够在检测到DNA损伤时,迅速结合到损伤位点,催化烟酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD+)分解,进而引发一系列修复反应。基于PARP1这一关键作用,PARP抑制剂应运而生,并且在临床试验中取得了一定的成果,部分药物已获批上市。
然而,PARP抑制剂在临床应用中存在着不容忽视的问题。其主要通过两种机制发挥作用,一是抑制PARP1的酶活性,阻碍DNA单链断裂修复;二是造成DNA捕获现象,使DNA-PARP1复合物持续存在,干扰其他酶对DNA单链断裂的修复,进而可能导致双链断裂,影响基因组完整性和细胞活力。更为棘手的是,PARP抑制剂的脱靶效应会引发一系列不良反应,如对PARP2的抑制可能导致,对tankyrases的抑制会引起恶心、呕吐和消化不良等症状,这严重限制了其临床应用。
在此背景下,PROTAC技术成为了研究的新方向。PROTAC分子由与目标蛋白结合的配体、与E3泛素连接酶结合的配体以及连接两者的连接子组成,能够利用细胞内的泛素-蛋白酶体系统降解特定目标蛋白,为解决PARP抑制剂的局限性带来了希望。
近期,同济大学研究团队在Cell Death Dis发表了题为Minimizing DNA trapping while maintaining activity inhibition via selective PARP1 degrader的研究论文,成功合成了基于Rucaparib和VHL配体的PROTAC 180055,能高效、选择性地降解PARP1并抑制其酶活性,避免DNA捕获效应,在体外和体内对携带BRCA突变的有杀伤作用且对正常细胞影响小,是极具潜力的癌症治疗药物。
在研发过程中,研究人员首先对多种组合进行了探索。最初尝试以Olaparib、Niraparib、Rucaparib作为PARP1结合剂合成PROTAC降解剂,结果发现180055(以Rucaparib为结合剂)在降低细胞内PARP1表达水平方面效果显著,而其他两种化合物效果不佳。同时,将180055中的VHLE3连接酶配体替换为CRBNE3连接酶配体得到的化合物180108,其降解PARP1蛋白的能力也十分有限。
进一步研究发现,Rucaparib结构中的仲胺部分位于溶剂暴露区域,在此处进行连接子连接无需过多结构修饰。于是研究人员连接了不同长度和类型的连接子与VHLE3连接酶配体,经过大量实验,最终确定了180055所采用的含8个碳原子直链烷基连接子为最佳选择,即使连接子长度仅有微小差异,也会对降解效果产生极大影响。
180055在多个方面展现出了卓越的性能。它能够在多种癌症细胞系中有效降解PARP1,在T47D和MDA-MB-231细胞系中的半最大降解浓度(DC50)分别为180 nM和240 nM,且在处理12小时后即可引发PARP1降解,这种降解效果可持续72小时,并且具有可逆性,其作用机制依赖于泛素-蛋白酶体系统。通过一系列严谨的实验验证,如单独使用Rucaparib或VH032不能诱导PARP1降解,而联合使用MG132可抑制180055诱导的降解等,充分证明了这一点。
图1:180055诱导PARP1降解
在特异性方面,基于质谱的定量蛋白质组学分析表明,180055对PARP1降解具有高度特异性,对PARP家族的其他成员如Tankyrase和PARP2并无降解作用。在酶活性抑制上,180055能够有效防止细胞内NAD耗尽,并且抑制PARP1酶活性,减少PAR化蛋白合成。
图2:180055阻断了PARP1的催化活性
在细胞保护和抗肿瘤效果方面,180055表现同样出色。与Rucaparib相比,它能显著减少PARP1在染色质上的捕获,降低DNA损伤,对细胞周期G2期的阻滞作用也较弱。在体外实验中,对BRCA1突变的MOLT4细胞具有显著的细胞毒性,而对正常心肌细胞系毒性较低。在体内缺陷NSG小鼠的MOLT4和A2780肿瘤异种移植模型实验中,180055与Rucaparib均能抑制肿瘤生长,但180055副作用更小,不会引起明显的体重减轻,对血液指标如红细胞计数、血红蛋白水平、血小板计数等的影响也较小,具有良好的生物安全性。
图3:180055保护细胞免受基因毒性诱导的细胞死亡
总的来说,180055作为一种新型的PARP1降解化合物,为癌症治疗提供了新的思路和方法。它有效克服了传统PARP抑制剂的部分局限性,在未来的癌症治疗研究中具有极大的潜力,值得进一步深入研究和临床试验,有望为癌症患者带来新的希望。(100yiyao.com)
参考文献:
Chen L, Zou Y, Sun R, et al. Minimizing DNA trapping while maintaining activity inhibition via selective PARP1 degrader.Cell Death Dis. 2024;15(12):898. Published 2024 Dec 18. doi:10.1038/s41419-024-07277-2
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