肠上皮依靠持续的干细胞驱动的更新来维持屏障功能和从损伤中恢复。虽然已知细菌信号会影响肠干细胞的行为，但肠分枝菌群落的再生能力在很大程度上仍未被探索。
2026年1月9日，中国医科大学丁辰、郑倩倩共同通讯在Nature Microbiology（IF=19.4）在线发表题为Fungal commensal promotes intestinal repair via its secreted peptide in mice的研究论文。该研究首次揭示肠道共生真菌Kazachstania pintolopesii（Kp）通过分泌蛋白Ygp1来源的活性肽CD12促进肠道修复。该研究拓展了肠道真菌的治疗潜力，将其定位为炎症性和医源性肠道疾病生物制剂的来源。
哺乳动物的肠道是一种动态组织，具有显著的自我更新和修复能力，由位于隐窝龛内的肠道干细胞(ISCs)维持，并不断补充上皮细胞。ISC驱动的再生的破坏损害了屏障的完整性，并使人易于在细胞毒性治疗后发生粘膜炎和炎症性肠病的恶化(IBD)，但目前还没有针对肠道损伤的靶向再生疗法。
来自宿主和微生物来源的外源信号是ISC行为的关键调节因素，但迄今为止，大多数工作都集中在微生物群的细菌成员上，而其他微生物界(如肠道真菌群落)的作用尚未完全确定。
在DSS诱导的结肠炎中，Kp促进IO分化并恢复肠道稳态（图源自Nature Microbiology）
在这里，研究人员确定共生真菌Kazachstania pintolopesii(Kp)通过其分泌的蛋白Ygp1作为肠道再生的关键介质。研究发现Ygp1的12-氨基酸肽片段CD12足以在结肠炎和化疗诱导的损伤的小鼠模型中促进肠器官样分化并加速肠愈合。
转录组学、模拟和分子相互作用实验揭示CD12结合哺乳动物α-烯醇化酶(ENO1)，增强YAP1 (Yes相关蛋白1)蛋白水平，并通过Hippo信号通路激活再生转录程序。表达CD12的工程益生菌复制了其治疗优势，提供了一种可翻译的递送策略。该工作扩展了真菌群落的治疗潜力，将其定位为炎症和医源性肠道疾病的生物制剂来源。
参考信息：
https://www.nature.com/articles/s41564-025-02233-y#Sec39